Importante muestra de la cultura Mapuche, compuesta por elementos recogidos en todo el territorio de Neuquén, el Museo Municipal Mapuche comenzó a funcionar en la semana del Aborigen de 1988 con una exhibición de restos arqueológicos traídos a Junín de los Andes por el sacerdote Pascual Marchesotti, quien en sus viajes por la Patagonia supo dar valor a los restos de esta cultura nativa de gran influencia en la zona.
Al ingresar al museo, en un pequeño rincón a la izquierda, se halla una zorrita gris, una cabeza de ciervo, piedras volcánicas, árboles petrificados, y un muestrario de algunas especies vegetales propias del bosque Andino Patagónico como el maitén, el chacay, el ñire y la siete venas que, a modo de curiosidad, sostiene una iguana.
En las distintas vitrinas y estantes se pueden observar instrumentos musicales, tejidos, matras, artesanías, dos grandes mapas, (uno con la ubicación de los pueblos aborígenes de la Argentina y el otro con las Comunidades Mapuches de la provincia del Neuquén), los que, junto con otros elementos, conforman el gran espectro del museo.
Se encuentra abierto al público de lunes a viernes de 9:00 a 12:00 y de 15:00 a 20:00
El museo aparece ubicado en calles Gines Ponte y Joaquín Nogueira.