La Basílica San Francisco es otro de los sitios históricos que los visitantes no pueden dejar de conocer. Está estructurada con tres naves y fue construida en ladrillos, con muros de 0,90 m de espesor, y doce grandes pilares con columnas corintias adosadas que separan los tres recintos.
Cuenta con un techo a dos aguas, sostenido por cabreadas y cielorraso abovedado.
Su emplazamiento sobreelevado permite un amplio atrio definido por cuatro anchos pilares.
Fue un proyecto de la Orden Franciscana, realizado por el arquitecto Urbano Barbier. Data de 1875 y es Monumento Nacional desde 1925, por cobijar la imagen de la Virgen del Carmen de Cuyo, Patrona y Generala del Ejército de los Andes y depositaria del Bastón de Mando del Gral. Don José de San Martín.