Originada a fines del Siglo XIX a raíz del asentamiento de familias inmigrantes españolas, inglesas, árabes e italianas, junto a aborígenes que habitaban la zona desde tiempos antiguos dedicándose a la actividad agrícola- ganadera, la localidad tuvo su fundación oficial en 1927 con el nombre de Nacimiento, por encontrarse en cercanías a la naciente del río Deseado.


Años más tarde sería rebautizada como Lago Buenos Aires, hasta que en mayo de 1952 finalmente recibe la denominación de Perito Moreno, en homenaje al naturalista que estudiara afanosamente la Patagonia realizando importantes aportes a la biología y la paleontología, y que luchara por afianzar la soberanía argentina en estos territorios.